I skolen lærte vi, at alle indtagne proteiner fordøjes via denaturering og opdeler den større makrostruktur i peptider og aminosyrer så små, at de kan absorberes, og som derefter genbruges af kroppen, uanset hvad den har brug for disse grundlæggende byggesten. Dette er angiveligt skæbnen for alle større proteinblokke og nødvendigt, da kun små peptider og aminosyrer kan komme ind i blodstrømmen.
Selvom dette kan være det normale tilfælde for normal proteinfordøjelse, kan denne model muligvis vise sig at være for generaliseret. For eksempel, hvis vi ser på visse prion-sygdomme, ser det ud til, at det forårsagende middel til disse sygdomme er infektiøse proteiner.
Hvis disse proteiner, der forårsager kuru, Creuzfeldt-Jakob, BSE, kan spredes via indtagelse af inficeret materiale, så ser ud til at 'overleve' fordøjelsesprocessen.
Scrapie-transmissionstilstande er blevet debatteret i mange år. Selvom eksperimentel transmission kan antage flere former, sker den naturlige transmission af scrapie vandret mellem individer gennem direkte kontakt mellem dyr og gennem kontakt med miljøforurening (gennemgået i Schneider et al., 2008). Scrapie erhverves overvejende via den orale vej, og moderkagen og fostervæsken er de mest almindelige kilder til oral infektion, selvom fosterdele, afføring og mælk alle har vist infektivitet (se Schneider et al., 2008).
Fra: KS MacLea: "Hvad skaber en Prion: smitsomme proteiner fra dyr til gær", International gennemgang af celle- og molekylærbiologi, bind 329, 2017, s. 227-276.
At store proteiner er aktive via den orale vej synes at være i modstrid med de grundlæggende principper for proteinfordøjelse. Spørgsmål, der opstår her: Overlever nogle proteiner menneskelig fordøjelse? Hvilke proteiner overlever? Hvordan eller hvorfor overlever de?
For at koge det ned: er den generelle model for proteinfordøjelse og absorption ufuldstændig med hensyn til større proteinstrukturer? Wikipedia siger ganske enkelt, at
PrP fundet i infektiøst materiale har en anden struktur og er resistent over for proteaser, de enzymer i kroppen, der normalt kan nedbryde proteiner.